经历几百年的发展，北京清真菜交融了阿拉伯饮食文化和中华饮食文化的精粹，沿袭了伊斯兰教规的内容，形成了自己独特的饮食禁忌和风味特点。其主要特点是：
第一，菜肴用料以伊斯兰教饮食习俗为基础。清真菜善制牛、羊肉、鸡、鸭以及一些海味等，用北京清真馆一句口头禅来说，就是原料为参、翅、骨、肚、菜、鸡、鸭、鱼、肉、面。
第二，烹调工艺精。北京清真菜由于受山东菜、淮扬菜的影响，烹调工艺较精细。如：对肉的使用上，必须用水将其浸泡至透，去净血水。这样做，一是符合了伊斯兰教人不食各种血液的习惯；二是烹出的原料外形和口感较之不去血液的都要好。在刀工处理上，北京清真菜也有其特点。如：对“丁”的处理，是切成长方形的“马牙丁”，成菜后称“里脊丁”，忌叫“肉丁”。在烹调方法上，北京清真菜擅长炸菜、善制炮、烤、涮，也精于蒸、烧、焖、熘、扒、炖、烩、汆、炒、拔（丝）等所有北方菜的烹调技法。
第三，菜肴味道以咸、鲜、爽、嫩，口感纯正为特征。既有清淡、爽口、鲜嫩的菜肴，如芫爆散丹、清炒里脊等；又有味醇、浓香的菜肴，如煨牛肉、扒海羊等。这些都是极有特色的美味佳肴。
在长期的实践中，信仰伊斯兰教的回族人民，创立了丰富多彩的北京清真菜。目前，清真菜正走向少汁少油、精美和清淡。讲究科学，注重营养，加工精致，这就是北京清真菜发展的方向。